自 2026 年 4 月 10 日起，歐盟「出入境系統」（Entry/Exit System, EES）已在使用該系統的 29 個歐洲國家所有外部邊境全面運作。這套系統以電子紀錄取代多數口岸的護照蓋章，登錄非歐盟旅客的旅行證件資料、入出境日期地點，以及生物辨識資料。台灣護照持有人赴申根區短期停留屬免簽，因此適用 EES；90 天／180 天規則本身沒有改，改的是計算方式從人工翻章變成中央系統自動加總。
法規與生效日：逐步實施到全面運作
法律依據是 Regulation (EU) 2017/2226，以及規範逐步上路的 Regulation (EU) 2025/1534。歐盟執委會把逐步實施的啟動日定在 2025 年 10 月 12 日；官方 FAQ 寫明，逐步實施持續到 2026 年 4 月 9 日，自 4 月 10 日起在所有使用該系統的外部邊境全面運作。執委會 4 月 10 日的公告也確認，護照蓋章改由數位入出境紀錄取代，並登錄臉部影像、指紋與旅行證件個人資料。
依官方 FAQ，免簽旅客（含台灣護照）系統會儲存 4 枚指紋與臉部影像；持短期簽證者通常只再存臉部影像，因為指紋已在簽證資訊系統（VIS）。未持生物辨識護照原則上仍可入境，但不能使用自助通關設備。拒絕提供生物辨識資料，依官方說明會被拒絕入境。
申根與稅務
申根與稅務：EES 沒有改寫《申根邊境法典》的短期停留規則。官方 FAQ 原文是：「The implementation of the EES changes nothing to the rules on short stays… 90 days in any 180 days。」29 國的停留天數合併計算；台灣護照自 2011 年起免簽，仍是「任何 180 天內最多 90 天」。系統會自動辨識逾期停留者（overstayer），並把資料列入清單供邊境、移民與核發簽證單位查閱。
要注意的是，逾期後果不是歐盟統一價目表。FAQ 只寫：依 Return Directive 2008/115 啟動遣返程序，原則上優先自願離境；入境禁令「in principle」不超過 5 年，且只在特定情形必須核發、其餘情形「may be issued」。罰款、拘留、是否再入境，官方寫的是「視各使用 EES 的歐洲國家國內法而定」。把「500 至 1,000 歐元罰款、最長 5 年禁令」寫成必然結果，超出官方原文。持數位遊牧簽證或各國 D 簽證／居留許可者，本來就不是這套短期停留規則的適用對象；西班牙稅務居民門檻仍是另一套國內法，EES 本身不決定你第 183 天要不要報全球所得。
在地反彈確實存在：南歐多城對短租與房價的抗議，已讓各國收緊居留寬容。但那是住房與簽證政策的脈絡，不是 EES 條文的一部分。EES 做的事比較乾脆：把過去靠印章模糊帶過的天數，改成系統加總。
適合誰、不適合誰
適合誰：本來就按 90／180 天精算行程的遠距工作者；會在額度用盡前轉往塞爾維亞、阿爾巴尼亞等非申根歐洲國家的人；以及收入與文件達標、改申請各國長期簽證或居留的人。不適合誰：把觀光免簽當長期居留、指望邊檢口頭放水的人。官方已寫明，自 4 月 10 日起人工蓋章廢止，自動計算器與逾期停留者清單開始運作。
台灣讀者若持含身分證字號的普通護照，免簽資格沒變，但首次入境要預留登錄生物辨識的時間。後續停留天數可查歐盟「Check how long you can stay」工具，或向最近一次入出境的會員國主管機關確認。詳見 歐盟執委會 2026 年 4 月 10 日公告。